学校肇始于1912年，前身为长沙红十字会看护训练所，1924年正式建立长沙仁术护病学校。1961年从长沙搬迁至安江建立黔阳地区卫生学校，1984年搬迁至怀化并更名为怀化地区卫生学校。2000年3月，升格为怀化医学高等专科学校。2014年5月，经教育部批准升格并更名为湖南医药学院。
学校占地面积1418亩，校舍建筑面积26.8万㎡，现有教学科研仪器设备总值9342万元，图书馆馆藏纸质图书77万册；学校设有医学院、药学院、护理学院等12个教学院部；学校是国家执业医师临床类别实践技能考试基地，有国家三级甲等综合性直属附属医院（临床学院）1所、非直属附属医院（临床学院）7所。
学校校本部现有在编在岗610人，其中专任教师399人。有教授、副教授等高职称教师190余人，具有博士学位教师34人、硕士学位教师323人；学校现有医学、管理学2个学科门类，开设临床医学、护理学等13个本科专业；有省级重点专业1个，省级特色专业2个，国家资源共享（精品）课程1门，省级精品课程5门，省级虚拟仿真实验教学中心2个。
办学95年来，学校为社会输送了近10万名医卫人才。学校先后获得“全国卫生系统先进单位”“全国学籍管理先进单位”“湖南省就业创业示范校”等多项荣誉。